简要履历
北京大学科学智能(AI for Science, AI4S)中心主任。分别在台湾大学，麻省理工学院，哈佛大学学习和工作。曾任麻省理工学院博士后、研究员，哈佛大学研究员、匹兹堡大学教授、北京大学客座教授、浙江大学光彪讲座教授、中山大学智能工程学院智能医疗中心主任教授。从事人工智能在药物、医学、化学、生物上的研究，Nature 子刊、Cell子刊和TPAMI等期刊和ICML、CVPR、AAAI会议论文370余篇，累计被引9800余次，H-index为54。在2020-2024年入选Elsevier中国高被引学者榜单（计算机学与技术领域）。 2021-2024年入选了全球学者学术影响力排行榜，2018-2024年同时入选全球World's Top 2% Scientists的“终身科学影响力排行榜(career-long impact)”和“年度科学影响力排行榜(single-year impact)”榜单。
AI4S实验室简介：将人工智能技术应用在生物、化学、医学上。
人才培养：注重算法和科学的交叉专业技能。
对研究生的期待：探讨科学，眼睛有光。
主要研究方向：AI药物设计、数字化学、AIGC化学反应数据库、大模型蛋白质环肽疫苗设计。
奖项及荣誉
2009 MIT 100 international young innovator awards
2010 "Professor Shi Yanping's Thesis Award"
2010 MIT Young Scientist Award (2010/11/8)
2010 Harvard University, Systems Biology, Outstanding research Award
2011 IEEE Senior Member, Institute of Electrical and Electronics Engineers
2013 Bentham Science high cited paper
2019 2019-2024 Stanford University World’s Top 2% Scientists
2019 2019-2024 highly cited (computer science and Technology)
2020 2020-2024 world top scientist
2022 Shenzhen Pengcheng Peacock Plan Overseas High-Level Talents
2022 Shenzhen City Young Scientific and Technological Talents
2024 Shenzhen Pengcheng Peacock Plan Overseas High-Level Talents
代表性成果
Recent Referee Papers
1) Ziduo Yang , Yi-Ming Zhao, Xian Wang, Xiaoqing Liu, Xiuying Zhang, Yifan Li, Qiujie Lv, Calvin Yu-Chian Chen*, Lei Shen*, Scalable Crystal Structure Relaxation Using an Iteration-Free Deep Generative Model with Uncertainty Quantification, Nature Communications, 2024, 15, 8148
2) Zhenchao Tang, Guanxing Chen, Shouzhi Chen, Jianhua Yao, Linlin You, Calvin Yu-Chian Chen, Modal-nexus auto-encoder for multi-modality cellular data integration and imputation, Nature Communications, 2024, 15, 1, 9021
3) Ziduo Yang, Weihe Zhong, Qiujie Lv, Tiejun Dong, Guanxing Chen, Calvin Yu-Chian Chen*, Interaction-Based Inductive Bias in Graph Neural Networks: Enhancing Protein-Ligand Binding Affinity Predictions from 3D Structures, IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, 2024, 46, 12, 8189-8208.
4) Haohuai He, Bing He, Lei Guan, Yu Zhao, Feng Jiang, Guanxing Chen, Qingge Zhu, Calvin Yu-Chian Chen*, Ting Li*, Jianhua Yao*, De novo generation of SARS-CoV-2 antibody CDRH3 with a pre-trained generative large language model, Nature Communications, 2024, 15:6867
5) Weihe Zhong#, Ziduo Yang#, Calvin Yu-Chian Chen*, Retrosynthesis prediction using an end-to-end graph neural network for molecular graph editing, Nature Communications, 2023, 14, 3009
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